推行职级并行规章制度以后，科级干部分成了四级、三级、二级、一级主任科员四个阶梯，四、三级是副科，二级、一级是正科。从工资待遇上看
一级主任科员二级主任科员的区别，也要把副科级实职、正科级实职加上，换句话说，从工资待遇上看来，从高到低，分别是一级主任科员、正科级实职、二级主任科员、三级主任科员、副科级实职、四级主任科员。
以正科级为例子，一级主任科员薪水最多，每月比正科级实职高200多块，二级主任科员每月比正科级实职低几十块钱。它是指职务级别薪水，也就是标准工资，别的补贴、补助、奖励金等层面，一二级主任科员和正科级实职是一样的。例如艰边补、岗位补贴、交通费等。例如公交车补助，一二级主任科员和正科级实职全是750元，没什么区别。副科级实职和三四级主任科员的工资待遇区别，也是一样的，分了三个阶梯，别的补助补贴工资待遇同样。
实际上，一二级主任科员的区别，并没有在工资待遇上面。一二级主任科员和正科级实职，全是正科级，在破格提拔晋升副处级实职的情况下，三者面对的机遇是一样的，只需够标准够期限，基础理论上面能够晋升，没什么区别。例如要破格提拔一个常务副检察长，一级主任科员毫无疑问合乎基本标准，没有说的，但二级主任科员和正科级实职，只需就职期限超出三年，都合乎晋升标准，这一点和一级主任科员没什么区别。
可是，假如要晋升职务级别，按职级并行规章制度，晋升副调研员，正科级实职、一级主任科员二级主任科员的区别就十分大。正科级实职仅有在套改、晋升一级主任科员后，假如扣减二级晋升一级后，任正科时长超出三年，就可以晋升副调研员。而二级主任科员仅有在晋升一级主任科员三年后，也才能够晋升一级主任科员。
