想想基因而不是性状。每个拥有特定突变等位基因的人一定是从突变最初出现的人那里继承了这种突变。科学家认为，在6000 - 10000年前的欧洲，OCA2-HERC2基因发生了突变，这种突变经常导致人们拥有蓝色的眼睛。
如果你有这种特定的突变，那么你就是其他所有有这种特定突变的人的远亲。但这并不意味着你和其他蓝眼睛的人有血缘关系，因为：该基因的作用是不一致的。有这种突变的人有的眼睛是蓝色的，有的不是。
这种基因还有其他的变异版本，可以导致人们拥有蓝色的眼睛。还有一些完全不同的基因会影响眼睛的颜色。不同版本（等位基因）的OCA2-HERC2基因在世界不同地区是常见的。这张图表显示了三种引起蓝眼的等位基因在全世界是多么普遍。你可以看到，中间图表中描述的等位基因在欧洲很常见，而其他的等位基因在世界上很多地方都很常见。
OCA2-HERC2基因是影响你拥有蓝色眼睛几率的最重要基因，但还有其他基因。
这个图表是一种染色体的地图，从左到右列出了它们从1到22，基因影响眼睛颜色的位置显示为高条。请注意，OCA2基因是最高的，因为它对眼睛颜色的影响最大。
人类眼睛的颜色并不属于固定的类别（蓝色和棕色）。相反，人们有不同程度的黑暗。基因控制着我们眼睛的颜色。非常深的眼睛看起来是棕色的，而非常浅的眼睛看起来是蓝色的。中间的看起来是绿色的。这张图表显示了这种变化。
不同的基因以复杂的方式相互作用。这张图表显示了15号、9号和11号染色体上特定基因的可能遗传模式。
科学家认为自然选择偏爱蓝色眼睛，从而导致了OCA2-HERC2基因的不同版本但他们不确定原因。也许古人认为蓝眼睛的人更漂亮，所以更喜欢和蓝眼睛的人结婚。这就是性选择。但也有其他的可能性。也许拥有蓝色的眼睛可以减少季节性情绪失调（冬季忧郁）。或者可能是蓝眼睛导致基因使肤色变亮，从而帮助人们获得足够的维生素D。
