基因半随机地位于染色体上，可以出现在DNA分子的任何一条链上。你可以通过观察任何给定染色体上的基因列表来了解它们是多么的随机。这张图表列出了与15号染色体相关的疾病。
基因顺序的一个方面并不是随机的。亲缘物种的基因顺序往往相似。这张图表显示了包含TRIM家族基因的人类11号染色体的一部分。图表的下半部分显示了黑猩猩染色体上的相应区域你可以很容易地看到，两个物种的许多基因都位于相似的位置。科学家称之为共线。
在漫长的进化过程中，染色体会重新排列很多次，但仍然有可能在不同物种间找到多个基因顺序相同的区域。这张图显示了几个远亲物种中dmrt6（蓝色）附近的基因。你可以看到它们的顺序是一样的。
你可以利用基因的相似性来找出不同物种中哪些染色体片段是相同的。这张图比较了人类（左）和老鼠（右）的染色体具有相同颜色的区域有许多相同的基因，并且顺序相似。例如，人类染色体上的黄色片段与老鼠的4号染色体上的基因相同。
